• analisi d'espressione (expression analysis)
• analisi filogenetiche (phylogenetic analysis)
• Helianthus annuus L.
• WUSCHEL-related homeobox

La famiglia multigenica wuschel-related homeobox (WOX) codifica fattori di trascrizione fondamentali per lo sviluppo della pianta e per la risposta agli stimoli ambientali. Queste proteine regolano l’organizzazione e lo sviluppo embrionale, il mantenimento delle cellule staminali e la formazione di molteplici organi.
La presente tesi si è sviluppata a partire da un gene WUSCHEL identificato in H. annuus. Partendo dalla sequenza amminoacidica nota, sono stati individuati 18 geni HaWOX (H. annuus-WOX) tramite ricerca di similarità sul proteoma. I geni candidati sono distribuiti in modo omogeneo sui 17 cromosomi di girasole, mostrando strutture geniche e proteiche simili e con caratteristiche distinguibili a seconda del gruppo filogenetico di appartenenza. I geni WOX risultano infatti divisi in tre cladi: ANTICO, INTERMEDIO, WUSCHEL. Per ciascuna proteina HaWOX sono stati individuati l’omeodominio e alcuni domini e motivi proteici specifici di ciascun clade. Studiando gli eventi di duplicazione abbiamo osservato l’importante ruolo delle Whole Genome Duplication (WGD) nella storia evolutiva di questa famiglia genica nel genoma di girasole. Infine sono state sfruttate librerie di cDNA accessibili pubblicamente per studiare la regolazione dell'espressione genica della famiglia WOX di girasole.
In conclusione, i dati ottenuti in questo lavoro identificano e caratterizzano per la prima volta i geni WOX nel genoma di una coltura economicamente rilevante come il girasole e possono rappresentare un punto di partenza per ulteriori studi funzionali relativi a questa famiglia genica.