ETD

• Anidrasi Carbonica
• dinamica molecolare
• docking
• inibitori solfonammidici

In questo lavoro di tesi è stato eseguito uno studio di dinamica molecolare su inibitori solfonammidici dell'anidrasi carbonica di tipo due con lo scopo di sviluppare un protocollo di dinamica molecolare in grado di valutare in modo efficiente le potenziali interazioni inibitore-proteina. Tale protocollo è stato poi applicato a sistemi ligando-proteina ridotti, comprendenti solo i residui amminoacidici relativi alla tasca catalitica dell’enzima e riuscendo così a triplicare la velocità di simulazione dell’intero processo. In questo modo è stato sviluppato un protocollo ottimizzato tale da poter essere applicato anche su un numero elevato di composti, come nel caso di un virtual screening.