Tesi etd-08182012-162840 |
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Tipo di tesi
Tesi di laurea magistrale
Autore
COIS, PAOLO
Indirizzo email
pal.cos83@gmail.com
URN
etd-08182012-162840
Titolo
Ricerca di bubbles nei grafi di de Bruijn e applicazione all'analisi di RNA-seq data
Dipartimento
INFORMATICA
Corso di studi
INFORMATICA
Relatori
relatore Pisanti, Nadia
Parole chiave
- alternative splicing
- Bioinformatica
- grafo de Bruijn
- kissplice
- mouthcycle
- single nucleotide polymorphism
- snp
Data inizio appello
12/10/2012
Consultabilità
Completa
Riassunto
Studio approfondito del contesto biologico legato alla formazione di particolari strutture dette bubbles nei grafi di de Bruijn generati da esperimenti di sequenziamento di RNA. Implementazione dell'algoritmo MouthCycle per l'individuazione delle bubbles ed integrazione dello stesso in uno strumento di analisi dati RNA-seq chiamato KisSplice con l'obiettivo di ridurne i tempi di esecuzione ed aumentarne le potenzialità di analisi.
File
| Nome file | Dimensione |
|---|---|
| Tesi_Pao..._0810.pdf | 3.61 Mb |
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