• binding di leganti
• dinamica molecolare
• docking
• mirabegron
• recettore accoppiato alla proteina G
• recettore adrenergico
• recettore adrenergico β3
• SR-59230A

Questa tesi esplora i meccanismi molecolari alla base della modulazione del recettore adrenergico β3 (β3AR), un recettore accoppiato alla proteina G (GPCR) coinvolto in funzioni metaboliche e cardiovascolari. Il lavoro si concentra su due leganti: mirabegron, un agonista del β3AR, e SR-59230A, una molecola dal comportamento farmacologico ancora non chiarito. Attraverso tecniche computazionali come il docking molecolare, la dinamica molecolare e tecniche enhanced sampling, lo studio analizza le dinamiche conformazionali del recettore nei suoi stati attivo e inattivo. Vengono monitorati parametri strutturali chiave per valutare l’attivazione del recettore, tra cui i movimenti delle eliche transmembrana, la rottura dello ionic lock, i toggle switch e la formazione di legami a idrogeno. I risultati evidenziano gli effetti dei due leganti e forniscono una visione atomistica dettagliata delle interazioni legante-recettore, offrendo spunti utili per il design razionale di farmaci.