Tesi etd-05242012-164459 |
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Tipo di tesi
Tesi di laurea magistrale
Autore
BRACCI, ELISA
URN
etd-05242012-164459
Titolo
Identificazione e caratterizzazione dei geni coinvolti nel Mesotelioma Pleurico Maligno
Dipartimento
SCIENZE MATEMATICHE, FISICHE E NATURALI
Corso di studi
BIOLOGIA MOLECOLARE E CELLULARE
Relatori
relatore Prof.ssa Gemignani, Federica
Parole chiave
- gene expression
- mesotelioma pleurico maligno
- target genes
Data inizio appello
14/06/2012
Consultabilità
Non consultabile
Data di rilascio
14/06/2052
Riassunto
Il Mesotelioma Pleurico Maligno (MPM) è un tumore raro, ma molto aggressivo, che colpisce la cavità sierosa della pleura. Questa neoplasia ha una prognosi infausta, compresa tra 9 e 17 mesi. Sono noti tre principali sottotipi istologici: epitelioide (il più comune), sarcomatoide e bifasico. Nonostante la complessa eziologia di questo tumore, il fattore predominante che causa il MPM è l’esposizione all’amianto, anche se è stato suggerito che altri co-fattori, come le infezioni dal virus SV40 e un aumento della suscettibilità genetica individuale, possano concorrere allo scatenarsi della malattia. L’incidenza del MPM, una volta raro, è aumentata nelle nazioni industrializzate come risultato della diffusa esposizione all’amianto. Nei prossimi decenni l’incidenza è destinata ad aumentare ulteriormente, soprattutto nei paesi in via di sviluppo, dove l’amianto non è stato ancora bandito. La difficoltà di una diagnosi precoce dovuta all’assenza di sintomi specifici, i pochi approcci terapeutici oggi disponibili e la rapida progressione del tumore, rendono necessaria la comprensione dei meccanismi molecolari coinvolti nella carcinogenesi e nella chemio-resistenza del MPM.
Lo scopo della presente tesi è stato quello di identificare i principali geni de-regolati del MPM, al fine di individuare nuovi potenziali biomarcatori d’interesse clinico per la neoplasia. A tal proposito, in seguito ad un’ampia ricerca in letteratura, sono stati selezionati 75 geni che possono essere cruciali per l’iniziazione, il mantenimento e l’evoluzione clonale del MPM. Al fine di verificare la riproducibilità dei risultati ottenuti dai diversi studi, è stata validata l’iper- o la down-regolazione dei geni individuati, utilizzando 16 tessuti “freschi” di MPM e 19 tessuti pleurici sani. Da ciascuno di essi è stato estratto l’RNA totale e, in seguito alla trascrizione inversa dell’mRNA in cDNA, è stata analizzata l’espressione di ogni gene target mediante real-time qPCR. I livelli di espressione dei geni selezionati sono stati normalizzati rispetto all’espressione dei geni di riferimento RPLP0, HPRT e TBP; la stabilità di questi ultimi è stata valutata mediante il software geNorm. L’analisi statistica dei dati è stata effettuata tramite il Wilcoxon test ad una coda. Dei 75 geni in analisi, 36 sono risultati de-regolati nel MPM, in maniera statisticamente significativa, anche dopo correzione per test multipli.
Lo scopo della presente tesi è stato quello di identificare i principali geni de-regolati del MPM, al fine di individuare nuovi potenziali biomarcatori d’interesse clinico per la neoplasia. A tal proposito, in seguito ad un’ampia ricerca in letteratura, sono stati selezionati 75 geni che possono essere cruciali per l’iniziazione, il mantenimento e l’evoluzione clonale del MPM. Al fine di verificare la riproducibilità dei risultati ottenuti dai diversi studi, è stata validata l’iper- o la down-regolazione dei geni individuati, utilizzando 16 tessuti “freschi” di MPM e 19 tessuti pleurici sani. Da ciascuno di essi è stato estratto l’RNA totale e, in seguito alla trascrizione inversa dell’mRNA in cDNA, è stata analizzata l’espressione di ogni gene target mediante real-time qPCR. I livelli di espressione dei geni selezionati sono stati normalizzati rispetto all’espressione dei geni di riferimento RPLP0, HPRT e TBP; la stabilità di questi ultimi è stata valutata mediante il software geNorm. L’analisi statistica dei dati è stata effettuata tramite il Wilcoxon test ad una coda. Dei 75 geni in analisi, 36 sono risultati de-regolati nel MPM, in maniera statisticamente significativa, anche dopo correzione per test multipli.
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