logo SBA

ETD

Archivio digitale delle tesi discusse presso l’Università di Pisa

Tesi etd-03212017-115040


Tipo di tesi
Tesi di laurea magistrale LM5
Autore
SOTTANI, SOFIA
URN
etd-03212017-115040
Titolo
Valutazione in silico di una piattaforma di target fishing basata su calcoli di docking: analisi del DUD dataset
Dipartimento
FARMACIA
Corso di studi
CHIMICA E TECNOLOGIA FARMACEUTICHE
Relatori
relatore Prof. Tuccinardi, Tiziano
Parole chiave
  • docking
  • DUD dataset
  • target fishing
Data inizio appello
27/04/2017
Consultabilità
Completa
Riassunto
Nel processo di Drug Discovery è importante conoscere i possibili target di un farmaco sia per motivi economici sia per abbreviare la durata temporale delle relative fasi di ricerca e sviluppo.
Per questi motivi può essere utile avere a disposizione una piattaforma di target fishing in grado di prevedere target primari e secondari per una molecola sottoposta ad uno studio accurato.
Con il target fishing si cerca di identificare tutti i possibili target per un dato composto chimico.
In questo lavoro di tesi sono stati condotti studi di tipo docking-based per individuare quale, tra i programmi di docking disponibili, basandosi sui valori di score ottenuti, fosse il migliore per creare una quanto più affidabile piattaforma di target fishing. Partendo dall'analisi del DUD dataset abbiamo costituito un database del quale è stato effettuato il docking attraverso 14 diversi programmi presenti nel nostro laboratorio.
File