• docking
• DUD dataset
• target fishing

Nel processo di Drug Discovery è importante conoscere i possibili target di un farmaco sia per motivi economici sia per abbreviare la durata temporale delle relative fasi di ricerca e sviluppo.
Per questi motivi può essere utile avere a disposizione una piattaforma di target fishing in grado di prevedere target primari e secondari per una molecola sottoposta ad uno studio accurato.
Con il target fishing si cerca di identificare tutti i possibili target per un dato composto chimico.
In questo lavoro di tesi sono stati condotti studi di tipo docking-based per individuare quale, tra i programmi di docking disponibili, basandosi sui valori di score ottenuti, fosse il migliore per creare una quanto più affidabile piattaforma di target fishing. Partendo dall'analisi del DUD dataset abbiamo costituito un database del quale è stato effettuato il docking attraverso 14 diversi programmi presenti nel nostro laboratorio.