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La Sclerosi Laterale Amiotrofica (SLA) è una patologia neurodegenerativa che colpisce il I e il II motoneurone.
Numerose ipotesi sono state formulate per identificare la causa della malattia e recentemente la comunità scientifica ha rivolto l’attenzione verso la trascrittomica, con particolare interesse per i geni SOD1, FUS e TARDBP.
Nonostante i numerosi studi, non è ancora stato chiarito se l’accumulo di queste proteine sia causato da errori post-traduzionali o post-trascrizionali.
Lo studio ha analizzato il profilo trascrizionale in 40 pazienti SLA e 40 controlli sani.
L’RNA totale è stato estratto ed analizzato utilizzando un protocollo di Whole Genome Sequencing (WGS) applicato al cDNA.
L’analisi dei dati è stata condotta utilizzando software statistici in grado di effettuare una stima dell’abbondanza relativa del trascritto principale e di tutti i trascritti alternativi presenti in ogni campione analizzato.
I dati mostrano nei pazienti rispetto ai controlli la presenza significativa delle isoforme:
ENST00000389995 - SOD1 (p<0,01)
ENST00000487045 – FUS (p<0,01)
ENST00000496840 – TARDBP (p<0,05)
ENST00000473869- TARDBP (p<0,05)
I risultati ottenuti in questo studio suggeriscono un ruolo patogenetico delle isoforme alternative nel meccanismo di aggregazione proteica intracellulare.
Tuttavia, per confermare la loro rilevanza patogenetica e distinguere eventuali sottogruppi di pazienti, è necessario ampliare il campione ed approfondire l’analisi delle alterazioni trascrizionali.

Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) is a neurodegenerative disease that affects the first and second motor neurons.
Numerous hypotheses have been formulated to identify the cause of the disease and recently the scientific community has turned attention towards transcriptomics, with particular interest in the SOD1, FUS and TARDBP genes.
Despite numerous studies, it has not yet been clarified whether the accumulation of these proteins is caused by post-translational or post-transcriptional errors.
The study analyzed the transcriptional profile in 40 ALS patients and 40 healthy controls.
The total RNA was extracted and analyzed using a Whole Genome Sequencing (WGS) protocol applied to cDNA.
The data analysis was conducted using statistical software capable of estimating the relative abundance of the main transcript and all the alternative transcripts present in each sample analyzed.
The data show the significant presence of isoforms in patients compared to controls:
ENST00000389995 - SOD1 (p<0,01)
ENST00000487045 – FUS (p<0,01)
ENST00000496840 – TARDBP (p<0,05)
ENST00000473869- TARDBP (p<0,05)
The results obtained in this study suggest a pathogenetic role of alternative isoforms in the mechanism of intracellular protein aggregation.
However, in order to confirm their pathogenetic relevance and distinguish any subgroups of patients, it is necessary to expand the sample and deepen the analysis of transcriptional alterations.