• PGP
• Pseudomonas fluorescens
• siderofori
• siderophores
• Tuber borchii

Tuber borchii è un tartufo, che stabilisce associazioni ectomicorriziche con diverse famiglie di piante arboree, caratterizzato da un complesso microbiota con proprietà plant growth promoting (PGP) e di biocontrollo, presente all’interno del carpoforo e nel suolo circostante. Lo scopo della tesi ha riguardato la caratterizzazione molecolare e funzionale di batteri, appartenenti al gruppo Pseudomonas fluorescens, associati a T. borchii proveniente da tre aree geografiche ad elevata vocazione tartufigena (Cecina, San Miniato e Montaione). La caratterizzazione molecolare degli isolati ha previsto l’amplificazione e il sequenziamento dei geni gyrB e rpoD. L’analisi delle sequenze del gene rpoD ha consentito l’attribuzione di 13 isolati a sette specie del gruppo fluorescens, identificando un numero maggiore di isolati rispetto al gene gyrB. P. fluorescens è la specie più diffusa nelle tre aree, anche se per ognuna è stata evidenziata la presenza di specie caratteristiche. La caratterizzazione funzionale ha previsto un’analisi qualitativa, basata sulla tecnica del doppio strato in piastra e l’utilizzo di un agar contenente il colorante Chrome Azurol S (CAS), che ha evidenziato la produzione di siderofori nel 93,2% degli isolati. L’analisi quantitativa, che si basa sull’utilizzo di una soluzione contenente CAS e successiva lettura dell’OD a 630 nm, ha consentito d’individuare tre isolati (C34, C53 e S60) con più elevata produzione e con un possibile futuro utilizzo come PGP.

Tuber borchii is a truffle, which establishes important ectomycorrhizal symbioses with several families of tree plants. Tuber borchii fruit bodies are associated to a complex microbiota, with plant growth promoting (PGP) and biocontrol properties, widespread within the carpophores and in the surrounding soil. The aim of the thesis is a molecular and functional characterization of bacteria belonging to the Pseudomonas fluorescens group, associated with T. borchii fruit bodies collected in three geographic areas (Cecina, San Miniato and Montaione) suitable for truffle-growing. The molecular characterization of the isolates was carried out by amplification and sequencing of the gyrB and rpoD genes. Thirteen isolates were identified and assigned to seven species of the fluorescens group by sequence analysis of rpoD gene, while only seven isolates were identified using gyrB sequences. P. fluorescens was the most widespread bacterial species but each geographic area showed the presence of different species. The functional characterization involved a qualitative assay, based on a double layer plate technique using a Chrome Azurol S (CAS) dye agar. The results showed that 93.2% of the isolates produced siderophores. The quantitative analysis, performed using a CAS solution with OD readings at 630 nm, allowed the identification of three isolates (C34, C53 and S60) with higher production, representing promising bacterial inocula for biocontrol and plant growth promotion.