• 16S rDNA
• AMF
• Next Generation Sequencing
• NGS
• PGPR
• salinity and water stresses
• sand dune systems
• sistemi dunali
• stress idrico e salino

La rizosfera è un ambiente dinamico in cui risiedono una grande varietà di microrganismi, tra cui i funghi micorrizici arbuscolari (AMF) e i batteri che si associano strettamente alle loro spore, che promuovono la crescita, nutrizione e salute delle piante aumentandone anche la tolleranza agli stress abiotici. Scopo della tesi è stato quello di caratterizzare gli AMF e il microbiota batterico, strettamente associato alle loro spore, presenti in un sistema dunale costiero, caratterizzato da stress salino e idrico, utilizzando tecniche morfologiche, molecolari e metagenomiche. Su base morfologica e molecolare sono state identificate le specie Racocetra persica, Racocetra fulgida, Septoglomus jasnowskae, Kamienskia bistrata e Kamienskia perpusilla. Dalle analisi metagenomiche sui batteri strettamente associati alle spore delle due Racocetra sp. sono stati identificati 14 Phyla, tra cui Bacillota (66.1%) e Actinomycetota (8.2%). 253 Amplicon Sequence Variants su 281 includevano batteri coltivabili, molti dei quali con caratteri plant growth promoters. La comunità batterica di R. persica è risultata più ricca di quella di R. fulgida e sono state individuate 16 specie indicatrici, tra cui alcune specie di rizobi e attinobatteri. Interessante il ritrovamento di due batteri endosimbionti degli AMF. Questi risultati rappresentano un punto di partenza per la ricerca di potenziali consorzi microbici utili ad aumentare la produttività delle colture in condizioni di stress idrico e salino.


Rhizosphere is a dynamic environment inhabited by a wide variety of microorganisms, including arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) and bacteria strictly associated with their spores. Rhizosphere microbiota can promote plant growth, nutrition and health, while increasing tolerance to abiotic stresses. The aim of this thesis is the characterization of AMF and bacterial communities strictly associated with AMF spores found in a coastal sand dune system – an environment characterised by salinity and water stresses – using morphological, molecular and metagenomic techniques. Based on morphological and molecular analyses the species Racocetra persica, Racocetra fulgida, Septoglomus jasnowskae, Kamienskia bistrata and Kamienskia perpusilla were identified. Metagenomic analyses of the two Racocetra sp spores-strictly associated bacteria allowed the identification of 14 Phyla, including Bacillota (66.1%) and Actinomycetota (8.2%). 253 Amplicon Sequence Variants out of 281 included culturable bacteria, many with plant-growth promoting properties. The bacterial community found in R. persica was richer than that of R. fulgida and 16 indicator species were detected, including some rhizobia and actinobacteria. Interestingly, two AMF endosymbiotic bacteria were found. These results provide a starting point for research into potential microbial consortia which may be useful for increasing crop productivity under salinity and water stress conditions.