Tesi etd-09232019-123346 |
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Tipo di tesi
Tesi di laurea magistrale
Autore
BOTTE, ERMES
URN
etd-09232019-123346
Titolo
Ottimizzazione di un bioreattore per lo sviluppo di un modello in vitro del microbiota intestinale umano
Dipartimento
INGEGNERIA DELL'INFORMAZIONE
Corso di studi
INGEGNERIA BIOMEDICA
Relatori
relatore Prof. Vozzi, Giovanni
tutor Dott. Biagini, Francesco
tutor Dott. Biagini, Francesco
Parole chiave
- bioreactor
- bioreattore
- finite elements models
- microbiota
- microbiota
- modelli agli elementi finiti
- prototipazione rapida
- rapid prototyping
- sforzo di taglio
- shear stress
Data inizio appello
11/10/2019
Consultabilità
Non consultabile
Data di rilascio
11/10/2089
Riassunto
L’obiettivo del presente lavoro di tesi è consistito nell’ottimizzazione e nella fabbricazione di una camera di coltura che consenta di coltivare in vitro il microbiota intestinale umano e di riprodurne un modello dinamico fisiologicamente rilevante, passando attraverso la definizione quantitativa delle specifiche di progetto per un tale sistema, su cui è stato fondato un paradigma di confronto sistematico tra possibili design di un bioreattore. Particolare attenzione è stata posta sui requisiti riguardanti lo sforzo di taglio: è stata infatti progettata e fabbricata una camera fluidica a sforzo di taglio controllato propedeutica allo sviluppo della camera di coltura, utilizzata per lo studio dell’influenza di questa azione meccanica su biofilm di singoli ceppi microbici e sul microbiota intestinale.
La tesi è articolata nei capitoli elencati e brevemente descritti di seguito:
• Capitolo 1: definizione del ruolo dei bioreattori nell’ambito dell’ingegneria tessutale e descrizione tecnica delle loro funzionalità, con particolare riferimento ad applicazioni di simulazione dell’ambiente intestinale e di generazione di profili di sforzo di taglio controllati.
• Capitolo 2: introduzione al ruolo dei modelli agli elementi finiti nella progettazione ingegneristica e determinazione del design ottimale per la realizzazione di una camera fluidica a sforzo di taglio controllato basata su simulazioni di fluidodinamica computazionale.
• Capitolo 3: studio di fabbricazione dei singoli componenti per due prototipi successivi della camera fluidica a sforzo di taglio controllato e progettazione e realizzazione di un adeguato sistema di chiusura che ne garantisca la tenuta idraulica.
• Capitolo 4: progettazione, fabbricazione e prototipazione elettronica di un box per la generazione ed il monitoraggio di condizioni di anaerobiosi, finalizzato a prove biologiche in cui siano coinvolti ceppi batterici anaerobi o il microbiota intestinale.
• Capitolo 5: descrizione delle prove sperimentali svolte per mezzo della camera fluidica ai fini della valutazione dell’influenza dello sforzo di taglio sulla crescita di biofilm composti da singole specie microbiche e di campioni di microbiota intestinale completo.
• Capitolo 6: individuazione dei principali requisiti di un bioreattore per lo sviluppo di costrutti batterici e definizione sulla base di essi di un paradigma per il confronto quantitativo tra le possibili geometrie di un tale dispositivo, al fine di ottimizzarne il design. Questa metodologia è stata quindi applicata per lo sviluppo e la fabbricazione di un prototipo di una camera di coltura per il microbiota intestinale umano, a partire dall’analisi agli elementi finiti dei principali fenomeni di trasporto in essa coinvolti.
La tesi è articolata nei capitoli elencati e brevemente descritti di seguito:
• Capitolo 1: definizione del ruolo dei bioreattori nell’ambito dell’ingegneria tessutale e descrizione tecnica delle loro funzionalità, con particolare riferimento ad applicazioni di simulazione dell’ambiente intestinale e di generazione di profili di sforzo di taglio controllati.
• Capitolo 2: introduzione al ruolo dei modelli agli elementi finiti nella progettazione ingegneristica e determinazione del design ottimale per la realizzazione di una camera fluidica a sforzo di taglio controllato basata su simulazioni di fluidodinamica computazionale.
• Capitolo 3: studio di fabbricazione dei singoli componenti per due prototipi successivi della camera fluidica a sforzo di taglio controllato e progettazione e realizzazione di un adeguato sistema di chiusura che ne garantisca la tenuta idraulica.
• Capitolo 4: progettazione, fabbricazione e prototipazione elettronica di un box per la generazione ed il monitoraggio di condizioni di anaerobiosi, finalizzato a prove biologiche in cui siano coinvolti ceppi batterici anaerobi o il microbiota intestinale.
• Capitolo 5: descrizione delle prove sperimentali svolte per mezzo della camera fluidica ai fini della valutazione dell’influenza dello sforzo di taglio sulla crescita di biofilm composti da singole specie microbiche e di campioni di microbiota intestinale completo.
• Capitolo 6: individuazione dei principali requisiti di un bioreattore per lo sviluppo di costrutti batterici e definizione sulla base di essi di un paradigma per il confronto quantitativo tra le possibili geometrie di un tale dispositivo, al fine di ottimizzarne il design. Questa metodologia è stata quindi applicata per lo sviluppo e la fabbricazione di un prototipo di una camera di coltura per il microbiota intestinale umano, a partire dall’analisi agli elementi finiti dei principali fenomeni di trasporto in essa coinvolti.
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