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Thesis etd-09222021-144945


Thesis type
Tesi di laurea magistrale
Author
QUARATIELLO, GIUSEPPE
URN
etd-09222021-144945
Thesis title
Analisi computazionale e di espressione delle "proteine killer" in Fusarium graminearum (Computational and molecular analysis of killer proteins in Fusarium graminearum)
Department
SCIENZE AGRARIE, ALIMENTARI E AGRO-AMBIENTALI
Course of study
BIOTECNOLOGIE VEGETALI E MICROBICHE
Supervisors
relatore Prof.ssa Nali, Cristina
relatore Dott.ssa Sarrocco, Sabrina
correlatore Dott. Guglielminetti, Lorenzo
Keywords
  • Fusariosi della spiga (Fusarium head blight)
  • Fusarium graminearum
  • Proteine "killer" ("killer" proteins)
  • Trichoderma gamsii
Graduation session start date
11/10/2021
Availability
Withheld
Release date
11/10/2061
Summary
Tra i numerosi metaboliti prodotti dai funghi, alcune proteine indicate con il termine ‘killer’ (KP) svolgono un ruolo nelle interazioni competitive, portando alla morte cellulare in organismi bersaglio.
Precedenti studi di trascrittomica, volti ad analizzare il cross-talk a distanza tra Fusarium graminearum (Fg), uno dei principali agenti causali della fusariosi della spiga di frumento, e l’isolato benefico Trichoderma gamsii T6085 (T6085), hanno evidenziato nel patogeno una sovra-espressione di quattro geni codificanti per proteine KP4-like (KP4-l) in risposta alla presenza dell’antagonista.
Scopo della presente tesi è stato quello di analizzare mediante un approccio computazionale, la distribuzione delle proteine KP4-l nel genere Fusarium e di studiare l’espressione dei geni codificanti per alcune di queste proteine nell’interazione tra Fg e T6085. Le analisi hanno permesso di individuare 52 KP4-l all’interno del genere Fusarium, la cui origine può essere ricondotta a duplicazioni geniche, riarrangiamenti o perdita di geni durante il processo di speciazione.
Il profilo di espressione dei geni kp4l-1, kp4l-2, kp4l-3 e kp4-l4 in Fg è stato analizzato in presenza di T6085 sia in colture duali che su spighe di frumento (Triticum aestivum cv Apogee). Nelle colture duali si è osservato un incremento significativo dell’espressione genica al diminuire della distanza tra le colonie dei due organismi, particolarmente per il gene kp4l-4, che è risultato essere anche l’unico differenzialmente espresso su spighe in presenza di T6085 sia a sette che a 14 giorni dall’inoculazione.
Sebbene i risultati suggeriscano una partecipazione delle KP nell’interazione tra Fg e T6085, ulteriori studi sono necessari al fine di delinearne il ruolo nell’interazione tritrofica frumento/Fg/T6085.
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