• 18S rDNA
• amplicon sequence variants
• cover crops
• glomeromycota
• indici di biodiversità
• inerbimento naturale
• metagenomica
• next generation sequencing
• virtual taxa

I funghi micorrizici arbuscolari (AMF) sono microrganismi benefici del suolo in grado di formare simbiosi mutualistiche con la maggior parte delle specie vegetali. Tali simbiosi avvantaggiano l’ospite in termini nutrizionali, ma influenzano anche la resistenza, la produttività, la qualità colturale e lo stato di aggregazione del suolo. Tali caratteristiche sono fondamentali in agroecologia e possono accompagnare pratiche agronomiche sostenibili per promuovere la salute e la fertilità del suolo. Scopo della tesi è stato quello di analizzare su periodo biennale la biodiversità delle comunità AMF presenti in campioni di suolo di un oliveto sperimentale sottoposto a inerbimento naturale e trattamento con cover crops. Una pipeline bioinformatica è stata perfezionata per l’analisi metagenomica delle comunità AMF presenti, con l’ottenimento di 231 sequenze uniche raggruppabili in 31 virtual taxa. Tra gli indici di diversità analizzati, sia il trattamento che il tempo hanno influenzato la Richness, i cui valori sono risultati inferiori nel trattamento con cover crops rispetto all’inerbimento nel primo anno con successivo aumento nel secondo anno. L’analisi PERMANOVA ha mostrato differenze significative nella struttura della comunità AMF tra i due anni di sperimentazione, ma non riguardo al tipo di trattamento. I risultati ottenuti dimostrano come un sistema agronomico più stabile e ricco di specie vegetali influisca positivamente la struttura delle comunità AMF nel suolo.