Tesi etd-07072007-162056 |
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Tipo di tesi
Tesi di dottorato di ricerca
Autore
Bonatti, Fabrizia
URN
etd-07072007-162056
Titolo
CARATTERIZZAZIONE DEL RUOLO PATOLOGICO DI MUTAZIONI MISSENSO DEL GENE BRCA1
Settore scientifico disciplinare
BIO/18
Corso di studi
ONCOLOGIA SPERIMENTALE E MOLECOLARE
Relatori
Relatore Dott. Caligo, Maria Adelaide
Parole chiave
- ANALISI RNA
- BRCA1
- BRCA2
- SAGGI FUNZIONALI
Data inizio appello
17/04/2007
Consultabilità
Non consultabile
Data di rilascio
17/04/2047
Riassunto
L’analisi mutazionale di 276 individui con storia familiare di tumore della mammella e/o dell’ovaio, attraverso il sequenziamento diretto delle intere regioni codificanti e delle giunzioni esone-introne dei geni BRCA1 e BRCA2, ha portato all’identificazione di numerose varianti missenso sia nuove che gia descritte. L’analisi in silico di queste varianti, ha permesso di evidenziare 8 potenziali varianti di splicing (2 in BRCA1 e 6 in BRCA2) e 7 varianti BRCA1 uniche non sinonime con alta probabilità di essere deleterie.
Lo scopo dello studio è di valutare l’effetto di queste 15 varianti missenso sulle funzioni di BRCA1 e BRCA2 attraverso l’analisi dell’espressione del mRNA, per le 8 varianti di splicing, ed un saggio funzionale in un modello in vivo in linee cellulari umane e di lievito per le 7 varianti missenso.
L’eventuale inattivazione funzionale, permette la classificazione di una variante come patogenetica e quindi di valutare più accuratamente il rischio di tumore nei soggetti carrier.
L’analisi del processamento del mRNA ha rivelato che BRCA1 c.IVS11+1G>A e BRCA2 c.IVS2+1G>A, c.IVS13-2A>G, c.IVS21+4A>G e c.9345G>A sono vere mutazioni deleterie. Lo studio dei saggi funzionali in lievito ed nell’uomo, suggeriscono che le varianti Y179C, I1766S e A1789T possono alterare le normali funzioni di BRCA1, mentre per la variante N132K ulteriori studi dovranno essere condotti.
Lo scopo dello studio è di valutare l’effetto di queste 15 varianti missenso sulle funzioni di BRCA1 e BRCA2 attraverso l’analisi dell’espressione del mRNA, per le 8 varianti di splicing, ed un saggio funzionale in un modello in vivo in linee cellulari umane e di lievito per le 7 varianti missenso.
L’eventuale inattivazione funzionale, permette la classificazione di una variante come patogenetica e quindi di valutare più accuratamente il rischio di tumore nei soggetti carrier.
L’analisi del processamento del mRNA ha rivelato che BRCA1 c.IVS11+1G>A e BRCA2 c.IVS2+1G>A, c.IVS13-2A>G, c.IVS21+4A>G e c.9345G>A sono vere mutazioni deleterie. Lo studio dei saggi funzionali in lievito ed nell’uomo, suggeriscono che le varianti Y179C, I1766S e A1789T possono alterare le normali funzioni di BRCA1, mentre per la variante N132K ulteriori studi dovranno essere condotti.
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