• ASO-PCR
• microRNA
• miRNA
• PTC
• SNPs

I miRNA (microRNA) sono piccole molecole di RNA a singolo filamento di 20-23 nucleotidi, che regolano negativamente l’espressione di altri geni tramite il loro appaiamento alla regione 3’UTR target. Una de-regolazione post-trascrizionale dell’RNA messaggero può essere uno dei meccanismi responsabili delle alterazioni oncogenetiche.
Abbiamo ipotizzato che la presenza di polimorfismi a singolo nucleotide (SNPs) all’interno della regione 3’UTR possa alterare il legame tra i miRNA e i loro target, influenzando la regolazione dei geni e il rischio individuale di sviluppare il cancro. In particolare, sono state selezionate le regioni 3’UTR di 43 geni considerati importanti per lo sviluppo del carcinoma papillare tiroideo (PTC) e, tramite specifici algoritmi, sono stati predetti i possibili siti target per i miRNA. Sono stati selezionati 37 polimorfismi in cui abbiamo valutato la forza di legame tra il miRNA ed il suo target predetto, nel caso in cui fosse presente o meno il polimorfismo. In questo modo sono stati identificati 3 polimorfismi aventi una variazione di energia libera di Gibbs (ΔΔG) tale da alterare il legame miRNA/target.
Ognuno di essi è stato valutato tramite uno studio di associazione di tipo caso-controllo su 311 casi affetti da PTC e 308 controlli per lo SNP rs701848 del gene PTEN, 284 casi e 291 controlli per lo SNP rs1621 del gene HGFR, ed infine su 755 casi e 732 controlli per lo SNP rs1042589 del gene TPO. Dopo aver genotipizzato i polimorfismi tramite una PCR-allele specifica, è stata eseguita un’analisi di regressione logistica multivariata.
Non è stata rilevata alcuna associazione statisticamente significativa tra i polimorfismi del gene HGFR e PTEN con il rischio di sviluppare il PTC, mentre per lo SNP del gene TPO analizzando un modello recessivo è stato ottenuto un Odd Ratio di 1,33 (95%, CI 1,00-1,77) che risulta ai limiti della significatività. Analizzando i dati utilizzando un modello recessivo con i 34 pazienti affetti da carcinoma follicolare della tiroide (FTC), l’associazione risulta statisticamente significativa con un Odd Ratio di 2.7 (95%, CI 1.19-6.12). La presenza del suddetto SNP potrebbe modulare il rischio di sviluppare FTC.