Tesi etd-05082020-171520 |
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Tipo di tesi
Tesi di laurea magistrale
Autore
MASOTTI, SIMONA
URN
etd-05082020-171520
Titolo
Post-transcriptional regulation of BRAF-X1 expression by isoform-specific RBPs
Dipartimento
BIOLOGIA
Corso di studi
BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Relatori
relatore Dott.ssa Poliseno, Laura
Parole chiave
- BRAF X1
- G3BP1
- ILF3
- MAP kinase pathway
- melanoma
- NCL
- PARP1
- post-transcriptional regulation
- RNA Binding Proteins
- ZN binding domain
Data inizio appello
25/05/2020
Consultabilità
Non consultabile
Data di rilascio
25/05/2090
Riassunto
Lo scopo di questo lavoro è stato quello di studiare la regolazione a livello post trascrizionale dell'isoforma BRAF X1, da parte delle proteine leganti l’RNA G3BP1, ILF3, NCL, PARP1.
Per prima cosa ho eseguito la validazione a livello molecolare dell’interazione tra le RBPs e l’RNA di BRAF X1 in cellule di melanoma A375, riscontrando una regolazione negativa dell’espressione di BRAF X1 da parte delle RBPs, dovuta ad una diminuzione della traduzione dell’RNA. Nel caso specifico di PARP1, ho dimostrato che la parte della proteina responsabile della regolazione dei livelli di espressione di BRAF è il dominio di legame all’RNA (PARP1 ZN). In particolare, ho messo in evidenza che l’overespressione del dominio PARP1 ZN in cellule di melanoma A375 (BRAFV600E e NRAS wt) comporta una diminuzione dei livelli di espressione di BRAF, così come un’inibizione dell’attività del pathway delle MAPK e una riduzione della proliferazione e migrazione cellulare.
Per espandere l’analisi ho svolto questi stessi esperimenti anche in altre linee di melanoma con differente stato mutazionale: SKMEL 103 (BRAF wt, NRAS mutato), MEWO (BRAF e NRAS wt) e il clone resistente al Vemurafenib C2 (BRAF V600E e variante di splicing BRAFV600E∆3-10), riscontrando che la regolazione post-trascrizionale di BRAF-X1 da parte delle RBPs può dipendere dal milieu mutazionale delle cellule di melanoma.
Per prima cosa ho eseguito la validazione a livello molecolare dell’interazione tra le RBPs e l’RNA di BRAF X1 in cellule di melanoma A375, riscontrando una regolazione negativa dell’espressione di BRAF X1 da parte delle RBPs, dovuta ad una diminuzione della traduzione dell’RNA. Nel caso specifico di PARP1, ho dimostrato che la parte della proteina responsabile della regolazione dei livelli di espressione di BRAF è il dominio di legame all’RNA (PARP1 ZN). In particolare, ho messo in evidenza che l’overespressione del dominio PARP1 ZN in cellule di melanoma A375 (BRAFV600E e NRAS wt) comporta una diminuzione dei livelli di espressione di BRAF, così come un’inibizione dell’attività del pathway delle MAPK e una riduzione della proliferazione e migrazione cellulare.
Per espandere l’analisi ho svolto questi stessi esperimenti anche in altre linee di melanoma con differente stato mutazionale: SKMEL 103 (BRAF wt, NRAS mutato), MEWO (BRAF e NRAS wt) e il clone resistente al Vemurafenib C2 (BRAF V600E e variante di splicing BRAFV600E∆3-10), riscontrando che la regolazione post-trascrizionale di BRAF-X1 da parte delle RBPs può dipendere dal milieu mutazionale delle cellule di melanoma.
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