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• Lentivirus dei Piccoli Ruminanti

Le infezioni da lentivirus dei piccoli ruminanti (Small Ruminant Lentiviruses: SRLV) sono caratterizzate dalla notevole varietà di stipiti che circolano tra diversi greggi ovini e caprini. La diagnosi si basa su tecniche di laboratorio di tipo indiretto e diretto.
Per la ricerca di anticorpi sono disponibili in commercio numerosi test ELISA, che impiegano come antigeni diverse preparazioni ottenute da una varietà di stipiti ma ognuno con una propria sensibilità a seconda del genotipo virale in causa.
Tra le tecniche dirette la PCR risulta la più utilizzata ma anche in questo caso l'elevata eterogeneità genetica degli SRLV rende difficile la ricerca di regioni omologhe sulla base delle quali individuare primers “universali”.
Lo scopo della tesi è quello allestire una PCR dotata di alta sensibilità e specificità per gli stipiti circolanti in Italia.
A questo fine sono stati impiegati numerosi stipiti virali isolati da greggi ovini e caprini provenienti da diverse regioni italiane.
Varie coppie di primer sono state disegnate utilizzando le sequenze italiane e non, attualmente disponibili in banca dati. Tali coppie sono state valutate sugli stipiti a nostra disposizione e su campioni di sangue provenienti da greggi ovini e caprini italiani sia in PCR convenzionale che in real time PCR (SYBR green).
Gli amplificati ottenuti sono stati confermati tramite sequenziamento, e i risultati analizzati in relazione con le sequenze pubblicate.