• conservation genetics
• microsatellite
• mitochondrial DNA

Abstract

The collared brown lemur, Eulemur collaris, is an Endangered (IUCN, 2013) prosimian inhabiting the littoral and lowland rainforests of south-eastern Madagascar. In the littoral forest, in particular, the species is threatened by severe habitat fragmentation, thus, only small populations survive in tiny fragments. Although many eco-ethological studies have been regarding these populations (Donati et al. 2007, 2011), no genetic surveys have been performed so far.

In order to support eco-ethological data and conservation policies, the genetic evolution of a small population translocated between fragments of the Mandena littoral forest was investigated over a period of twelve years (2000-2011). Moreover, the genetic diversity of populations inhabiting neighboring littoral (Nahampoana) and lowland (Tsitongambarika) forests was investigated.

DNA was recovered from a total of 25 ear clips and 38 faecal samples of collared brown lemurs. Variants at ~300 bp of the mitochondrial DNA (D-loop region) and eight autosomal microsatellite loci were investigated.

Both mtDNA and microsatellite results show that the Mandena fragment, throughout the 12 years period, underwent a very dynamic turn-over. The comparison between Mandena and Tsitongambarika genetic pools does not rule out a genetic flow between the two areas and suggested that genetic diversity and habitat degradation are negatively correlated.


Riassunto

Il lemure dal collare, Eulemur collaris, è una proscimmia, indicata come Endangered (IUCN 2013), che vive nelle foreste litorali e di montagna di media-bassa altitudine, del Sud-Est del Madagascar. Nella foresta litorale, in particolare, la specie è minacciata da una forte frammentazione dell’habitat, quindi, solo popolazioni numericamente esigue sopravvivono in piccoli frammenti. Sebbene molti studi eco-etologici abbiano interessato queste popolazioni (Donati et al. 2007, 2011), nessuna indagine genetica è mai stata realizzata.

Per supportare i dati eco-etologici e individuare politiche di conservazione, è stata studiata l’evoluzione genetica, su un periodo di 12 anni (2000-2011), di piccole popolazioni traslocate fra frammenti della foresta litorale di Mandena. Inoltre è stata confrontata la diversità genetica con popolazioni di foreste litorali (Nahampoana) e di montagna di media-bassa altitudine (Tsitongambarika).

Il DNA è stato estratto a partire da 25 campioni di ear clips e 38 di feci, appartenenti a lemuri dal collare. Sono stati genotipizzate ~300 bp appartenenti al mtDNA (D-loop region) e 8 loci microsatellitari autosomici.

Sia i risultati mitocondriali che quelli microsatellitari mostrano che il frammento di Mandena, nell’intervallo di tempo di 12 anni, è stato sottoposto ad un rapido turnover. Il confronto tra le caratteristiche genetiche della popolazione di Mandena e Tsitongambarika non esclude un flusso genetico tra le 2 aree e indica che la diversità genetica e la degradazione dell’habitat sono correlate negativamente.