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Archivio digitale delle tesi discusse presso l'Università di Pisa

Tesi etd-01072022-175155


Tipo di tesi
Tesi di laurea magistrale
Autore
ZAMPIERI, GIORGIA
URN
etd-01072022-175155
Titolo
Risposta del microbioma procariotico associato alle spugne Petrosia ficiformis e Ircinia oros alla traslocazione in aree marine urbane
Dipartimento
BIOLOGIA
Corso di studi
BIOLOGIA MARINA
Relatori
relatore Prof. Bulleri, Fabio
relatore Prof.ssa Vannini, Claudia
Parole chiave
  • microbioma
  • Porifera
  • spugne
  • sponge
  • metabarcoding
  • Ircinia oros
  • sequenziamento
  • Petrosia ficiformis
  • shift
  • traslocazione
Data inizio appello
25/01/2022
Consultabilità
Non consultabile
Data di rilascio
25/01/2062
Riassunto
I Porifera sono invertebrati marini il cui successo deriva dalla loro notevole capacità di filtrare efficacemente il materiale sospeso nella colonna d'acqua, sia organica che inorganica. Non sorprende che le spugne siano riconosciute come bioindicatori e biorimediatori. Questi organismi sono olobionti, ospitano permanentemente una comunità microbica che contribuisce alla sopravvivenza e al funzionamento dell'ospite stesso. I batteri associati alle spugne possono variare sia tra specie diverse che tra individui conspecifici, probabilmente sotto l'influenza di fattori ambientali. Lo scopo di questo lavoro di tesi è quello di indagare la risposta del microbioma di due specie di spugna (Petrosia ficiformis e Ircinia oros) dopo la traslocazione in area portuale. L'esperimento ha avuto luogo da settembre 2020 a luglio 2021. Frammenti di spugna sono stati prelevati dalla località di Nisportino (LI) e spostati in un impianto di allevamento (costituito da telai e reti) situato presso la darsena di Portoferraio. Il microbioma delle due specie di spugna è stato caratterizzato tramite metabarcoding e attraverso il sequenziamento, sulla piattaforma Illumina Miseq della regione V3-V4 del gene 16S rRNA. L'analisi della composizione microbica è stata condotta utilizzando il programma QIIME 2 e ha rivelato la prevalenza di phyla microbici noti per essere comunemente associati con spugne. L'analisi della varianza ha rilevato differenze significative nella composizione del microbioma tra le due specie di spugna, suggerendo un effetto dell'identità dell'ospite nella selezione dei simbionti. L'effetto della traslocazione è risultato altamente significativo nella composizione del microbioma, anche se le due specie hanno risposto in modo diverso alla traslocazione.

Sponges (phylum Porifera) are marine invertebrates whose success probably derives from their remarkable ability to effectively filter the suspended material in the water column, whether organic or inorganic. Not surprisingly, sponges are recognized as bio-indicators and bio-remedies. These organisms are also holobiont, they permanently host a bacterial community (∼60 Phyla) which contribute to the survival and functioning of the host itself. Sponge associated bacteria can varies both between different species and between conspecific individuals, probably under the influence of environmental factors. The aim of this thesis work is to investigate the response of the microbiome of two species of sponge (Petrosia ficiformis and Ircinia oros) following translocation in urban area. The experiment took place from September 2020 to July 2021. Sponge fragments were taken from the locality of Nisportino (LI) and moved to a breeding plant (consisting of frames and nets) located at the dock in Portoferraio. The bacterial microbiome of the two species of sponge was characterized by the metabarcoding approach, through sequencing on Illumina MiSeq platform of the V3-V4 region of 16S rRNA gene. Analysis of microbiome composition was conducted using the open source program QIIME 2 and revealed the prevalence of microbial phyla known to be commonly associated with sponges. Multivariate variance analysis found significant differences in the composition of the microbiome between the two sponge species, suggesting an effect of the host identity in selecting symbionts. The effect of translocation was also highly significant in the composition of the sponge microbiome, although the two species responded differently to the translocation.
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