• START
• colesterolo

L’obiettivo di questa tesi è stata la determinazione in silico della disposizione di legame del colesterolo all’interno della proteina STARD3, della quale negli ultimi anni (2000, 2016) sono state risolte due strutture cristallografiche nella forma non legata (apo). Risultando noto pertanto che tale proteina lega il colesterolo, ma rimanendo attualmente ignota la disposizione di legame, si è deciso di investigare quest’ultima attraverso un approfondito studio di docking molecolare. Tale indagine risulta di particolare interesse se si considera la summenzionate sovraespressione di STARD3 in alcuni carcinomi mammari. Questo lavoro di tesi può quindi rappresentare un punto di partenza nei termini e nei limiti della ricerca di eventuali composti attivi volti a combattere il tumore.
Lo studio computazionale è stato diviso in due parti: il primo passaggio è stato eseguire uno studio di docking approfondito volto a identificare un possibile binding mode per il colesterolo nel sito di legame della STARD3. In un secondo tempo è stata eseguita la dinamica molecolare per verificare quale delle pose suggerite dal docking risultasse essere la più stabile sia da un punto di vista energetico che di disposizione/profilo di interazione.