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Le interazioni proteina-proteina e la formazione di complessi multiproteici sono meccanismi fondamentali in molti processi biologici, quali la trasmissione dei segnali provenienti dall’esterno, l’adesione cellulare, lo sviluppo e la comunicazione tra cellule. Specifiche proteine svolgono un ruolo cruciale per mediare queste interazioni e reclutare recettori, enzimi, adattatori in determinati compartimenti cellulari. Questa tesi si propone di caratterizzare la proteina VSP (Ventral Eye Staining Protein), il cui gene, identificato in Danio rerio, è prevalentemente espresso nella retina neurale ventrale, nel tratto iniziale del peduncolo ottico e nei gangli dorsali durante gli stadi precoci dello sviluppo; successivamente la sua espressione è estesa anche ad altre regioni del sistema nervoso. Un potenziale interattore di VSP è la proteina ARMS (Ankiryn Rich-repeat Membrane Spanning), precedentemente isolata nel nostro laboratorio mediante esperimenti di phage display. Anche questa proteina è espressa specificatamente nei gangli dorsali e in varie regioni del sistema nervoso; inoltre è stato dimostrato che si concentra alla punta dei neuriti in cellule neuroendocrine PC12 indotte con NGF (Bracale et al., 2006). Durante il mio progetto di tesi ho analizzato l’espressione di queste due proteine, prodotte in forma ricombinante come prodotti di fusione ad epitopi facilmente riconoscibili da anticorpi di uso commerciale (HA e FLAG), utilizzando come sistemi modello per studiarne le interazioni cellule neuroendocrine di ratto, PC12 e cellule umane embrionali di rene, Hek293. Mediante trasfezione, analisi elettroforetica e Western blotting ho potuto verificare la corretta produzione delle proteine ricombinanti. Il passo successivo è stato effettuare esperimenti di co-immunoprecipitazione e co-localizzazione, che hanno permesso di dimostrare l’interazione diretta tra le due proteine. In particolare, la proteina VSP lega l’estremità carbossi-terminale di ARMS, tramite un dominio strutturale PDZ, specializzato per riconoscere specificamente gli ultimi quattro residui del bersaglio. Ulteriori esperimenti di co-immunoprecipitazione e co-localizzazione per confermare l’interazione tra le corrispondenti proteine endogene sono attualmente in fase di esecuzione.